L'histoire se déroule à Gama Gama Aquarium, un aquarium situé dans la ville d'Okinawa. Kukuru Misakino, une étudiante âgée de 18 ans qui y travaille, connaît le secret de cet aquarium : de temps en temps, on peut observer des choses étranges. Un jour, Kukuru rencontre Fuuka Miyazawa alors qu'elle se tient devant l'un des aquarium, les larmes aux yeux. Fuuka a abandonné son rêve de devenir une idol et s'est enfuie de Tokyo. Désirant trouver sa place, Fuuka demande sérieusement à travailler à l'aquarium.

Nous allons ainsi suivre le quotidien de Kukuru et Fuuka alors qu'elles essaient de comprendre les mystères de l'aquarium tout en faisant face à la crise qui menace de fermer cet endroit.